Ca cao có 3 nhóm chính:

Criollo: Hạt có chất lượng rất cao do có hương cacao đặc trưng, cây phát triển kém, lá nhỏ, rất mẫn cảm với sâu bệnh

- Forastero: Được trồng rộng rãi trên thế giới, có năng suất cao. Trong nhóm này loại Amelonado được trồng chủ yếu ở Châu Phi và Nam Mỹ.

- Trinitario: Có nguồn gốc từ Trinidad là con lai của hai loại trên.

Hiện nay tại Việt Nam, Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn đã phê duyệt bộ giống ca cao được phép sử dụng rộng rãi trên cả nước. Đó là các dòng vô tính TD1, TD2, TD3, TD5, TD6, TD8, TD10, TD14 do trường đại học Nông Lâm thành phố Hồ Chí Minh tuyển chọn. Đây là những dòng vô tính có tiềm năng năng suất từ 2 đến 5 tấn/ha.

Công ty CP Cao Nguyên Xanh có vườn đầu dòng với đủ 8 giống nêu trên và đang sản xuất cây giống ghép của các dòng này để cung cấp cho nông dân. Vì ca cao là cây thụ phấn chéo nên chúng tôi khuyến cáo và con nên trồng ít nhất 3-5 giống trên vườn nhà mình và trồng xen kẽ các giống với nhau để đảm bảo năng suất cao nhất.